НЛО наводнили небеса городов по всей земле. Пришельцы терроризируют, проводят опыты и убивают мирное население городов. Что-то должно быть сделано! XCOM, или подразделение по борьбе с терроризмом, было создано для борьбы с инопланетной угрозой. Вы начинаете игру, имея в своем распоряжении одну базу, два перехватчика, один транспорт и небольшое количество солдат и ученых. Вы должны остановить пришельцев!
Игра X-COM имеет как бы два режима: в одном из них вы управляете своей базой, проводите исследования, покупаете и производите вооружение, во втором вам предстоит сражаться с инопланетянами. Этот режим имеет 3D изометрический вид, вот тут-то вам и пригодятся все ваши исследования, так как вы столкнетесь с инопланетным разумом лицом к лицу.